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MassChroBook

全サンプルについて、マスクロマトグラムの全体像を、2次元画像で表したものです。 ポジティブモード、ネガティブモードごとに、パワーポイントファイルとしてダウンロードできます。 また、データの見かたの解説も同梱されています。

「MassChroBook_things_***_jp/en_++++++.zip」というファイル名の3桁の数字(***)は サンプル番号の最初の3桁を、6桁の数字(++++++)はファイルの更新日を表しています。

日本語版

MassChroBook_things_221_ja_210920.zip(zip形式 47MB)
サンプル番号: 221001~221071、2021年9月20日 更新
MassChroBook_things_222_ja_220716.zip(zip形式 71MB)
サンプル番号: 222001~222122、2022年7月16日 更新
MassChroBook_things_223_ja_211121.zip(zip形式 60MB)
サンプル番号: 223001~223109、2021年11月21日 更新
MassChroBook_things_224_ja_220714.zip(zip形式 81MB)
サンプル番号: 224001~224150、2022年7月14日 更新
MassChroBook_things_225_ja_220622.zip(zip形式 108MB)
サンプル番号: 225001~225178、2022年6月22日 更新
MassChroBook_things_226_ja_221021.zip(zip形式 60MB)
サンプル番号: 226013~226116、2022年10月21日 更新
MassChroBook_things_227_ja_230208.zip(zip形式 65MB)
サンプル番号: 227001~227121、2023年2月8日 更新
MassChroBook_things_228_ja_230217.zip(zip形式 33MB)
サンプル番号: 228001~228057、2023年2月17日 更新
MassChroBook_things_230_ja_240822.zip(zip形式 33MB)
サンプル番号: 230001~230075、2024年8月22日 更新

英語版

MassChroBook_things_221_en_210920.zip(zip形式 47MB)
サンプル番号: 221001~221071、2021年9月20日 更新
MassChroBook_things_222_en_220716.zip(zip形式 71MB)
サンプル番号: 222001~222122、2022年7月16日 更新
MassChroBook_things_223_en_211121.zip(zip形式 60MB)
サンプル番号: 223001~223109、2021年10月21日 更新
MassChroBook_things_224_en_220714.zip(zip形式 81MB)
サンプル番号: 224001~224150、2022年7月14日 更新
MassChroBook_things_225_en_220622.zip(zip形式 108MB)
サンプル番号: 225001~225178、2022年6月22日 更新
MassChroBook_things_226_en_221021.zip(zip形式 60MB)
サンプル番号: 226013~226116、2022年10月21日 更新
MassChroBook_things_227_en_230208.zip(zip形式 65MB)
サンプル番号: 227001~227121、2023年2月8日 更新
MassChroBook_things_228_en_230217.zip(zip形式 33MB)
サンプル番号: 228001~228057、2023年2月17日 更新
MassChroBook_things_230_en_240822.zip(zip形式 33MB)
サンプル番号: 230001~230075、2024年8月22日 更新

 

サンプルリスト


サンプルIDとサンプル名、カテゴリー名、 NCBIタキソノミーIDなどの情報を、 Google スプレッドシートでご覧いただけます。 ダウンロードも可能です。

 

PowerGetBatchパラメーターファイル


ピーク検出や、アラインメント等に用いたPowerGetBatchソフトウェアのパラメーター設定ファイルです。 PowerGetBatchは、このページ下部のリンクから入手できます。

PowerGetBatch パラメーターファイル(zip形式 25 KB)更新日: 2022年7月23日

 

過去のデータ


本レポジトリを用いて行ったデータ解析結果について、その再現性を担保するため、 既存のデータを上書きするようなデータの更新が行われた場合などに、 それまでのデータをアーカイブしています。
※下記の「LC-MSデータ」で配布しているマスクロマトグラムのデータファイル(生、mzXML形式)は変更しません。 また、ピークデータは、必要時に適宜変更され、必ずしもアーカイブと一致しませんので、ご了承ください。

manual_previousData_jp.pdf(491 KB)
データの内容や使い方の詳しい説明書です。
archive_ThingMR_220305.zip(615 MB)
公開日: 2022年3月5日、アーカイブ日: 2022年4月18日
archive_ThingMR_220418.zip(670 MB)
公開日: 2022年4月18日、アーカイブ日: 2022年4月18日
archive_ThingMR_220625.zip(911 MB)
公開日: 2022年6月25日、アーカイブ日: 2022年6月25日
archive_ThingMR_220723.zip(1.14 GB)
公開日: 2022年7月23日、アーカイブ日: 2022年7月23日
archive_ThingMR_221024.zip(1.20 GB)
公開日: 2022年10月24日、アーカイブ日: 2022年10月24日
archive_ThingMR_230217.zip(1.29 GB)
公開日: 2023年2月17日、アーカイブ日: 2023年2月17日
archive_ThingMR_240206.zip(1.33 GB)
公開日: 2024年2月6日、アーカイブ日: 2024年2月6日
archive_ThingMR_240822.zip(1.35 GB)
公開日: 2024年8月22日、アーカイブ日: 2024年8月22日

 

全サンプルのアラインメントデータ


アラインメントとは、サンプル間において、m/z値および保持時間が近く 同一成分由来と思われるピークを対応付けする作業のことです。 本データは、物レポに含まれる全サンプルのデータを使ってアラインメントを行い、 サンプル vs 独立成分を、タブ区切りの表形式にしたものです。
※アラインメントの計算は大きな計算機コストと時間を必要とするため、不定期に実施しています。

readme_alignmentData_ja.pdf(167 KB)
データの内容の詳しい説明書です。
alignment_ThingMR_535_220415.zip(513 MB)
2022年3月5日までに公開された535サンプルを集計した結果。
公開日: 2022年7月27日、作成日: 2022年4月15日

 

LC保持時間の変換ツール


物レポと、食レポ・植レポの間で、LCの保持時間を相互に変換するためのExcelシートです。 ご自分で変換式を作るときのご参考などにもご利用頂けます。
※変換された値は目安です。完全に一致するわけではありませんのでご了承ください。

 

LC-MS データ


サンプルごとに、検出されたピークのリスト、分析したLC-MSの生データ(ThermoFisher .raw形式)、およびそれをmzXML形式に変換データをダウンロードできます。 各サンプルの詳細情報へのリンクもあります。 mzXML形式のマスクロマトグラムデータとピークリストは、下記のMassChroViewerソフトで閲覧できます。

 

MassChroViewerソフト



上記でダウンロードしたmzXMLデータ、およびピークデータは、MassChroViewerソフトで開くことができます。 詳細なピーク情報の確認や、MSnデータの閲覧等が可能で、候補化合物の化学構造を見ながらMSnフラグメントの 解釈をするためのツールなども利用でき、化合物推定に役立ちます。MassChroViewerソフトは、 学術目的フリーでご利用いただけます。

 

PowerGetBatchソフト


ピーク検出、アラインメントに用いたPowerGetBatchソフトウェアは、こちらのサイトからダウンロードできます。 学術目的フリーでご利用いただけます。