ダイズメタボロームレポジトリ(豆レポ)は、世界のダイズコアコレクション からご提供いただいたダイズ品種について、液体クロマトグラフィー-質量分析(LC-MS)による 代謝成分の網羅的分析(ノンターゲット・メタボローム解析)を行ったデータを公開するデータベースです。

MassChroBook

2D画像をパワーポイントで見られます。


サンプル情報

世界のダイズコアコレクション (農業生物資源ジーンバンク)より提供された80系統のうち、 生育させることができた79系統の葉を分析しました。系統番号(GmWMC)011、018、024、159、163、176、183はについては、 2回ずつ、それ以外は1回ずつサンプリングし、合計86サンプルの分析データを得ています。


mGWASデータベース

各ダイズ系統から得られた、ノンターゲット・メタボロームデータ(未同定成分を含む網羅的な成分検出データ)と、 各系統のゲノム情報を用いて、代謝物-ゲノムワイド関連解析(mGWAS)を実施しました。
下記データベースでは、代謝物ピークから遺伝子、遺伝子から代謝物ピーク、など、mGWASの結果を自由に閲覧・解析でき、 新たな代謝物-遺伝子の関連性を探索できる可能性があります。

mGWAS search


文献情報

豆レポおよび、mGWAS searchについては、以下の公開論文をご参照ください。

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ご注意! 成分の解釈について
このサイトで提供されている化学成分の情報は、成分ごとにきちんとした定性・定量分析を行った結果ではありません。 このため以下にご留意下さい。
  • 候補として示された成分がそのサンプルに含まれることを保証するものではありません
  • 候補にない成分が、そのサンプルに含まれていないことを保証するものではありません
本サイトでは、特定のLC-MS分析条件で検出されたピークの質量値を、既知化合物のデータベースで 検索し、近い質量値を持つ化合物を列挙しているだけにすぎません。このため、多くの偽陽性・偽陰性が 含まれていることを、予めご了承下さい。 LC-MSを用いたノンターゲットメタボローム解析の正しい知識のもと、適切にデータをご利用下さい。

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